表观遗传三维进阶教学设计
呈现2025年曹晓风院士团队在《Cell》发表的研究概要。讲述实验现象:“研究发现,在减数分裂期经历过低温胁迫的水稻,其后代即便在常温下生长,也表现出了显著的耐寒性,且全基因组测序显示其 DNA序列并未发生突变。”
提问:“依据经典遗传学的‘中心法则’,性状的改变通常源于DNA序列的变化。既然DNA序列没有变,这种‘获得性’的耐寒性状是如何遗传给后代的?难道拉马克的‘获得性遗传’是完全正确的吗?”
回顾孟德尔遗传规律和中心法则,指出该实验现象与已有认知(DNA序列决定性状)的矛盾点。
进行头脑风暴,提出假设(如:细胞质遗传、某种物质修饰等),进入“知其然不知其所以然”的愤悱状态,激发探究欲望。
引导学生思考在DNA序列之外,是否还存在其他的遗传调控机制,从而引出“表观遗传”的概念。
讲解“基因封条”隐喻。将DNA甲基化比作给基因贴上“封条”,导致转录机器无法结合(基因沉默);将去甲基化比作“撕去封条”,基因得以表达。
展示文中提及的图2a(ACT1基因调控机制)及图3(教学化后的柱状图)。介绍关键角色:耐寒基因 ACT1 、转录因子Dof1、甲基转移酶MET1b。
提出问题链:“冷敏感型水稻的 ACT1 基因处于什么状态?低温胁迫如何影响MET1b酶?‘封条’(甲基化)发生了什么变化?最终导致了什么结果?”
分析图3柱状图,发现低温处理组的甲基化水平显著降低,而 ACT1 表达量显著升高。
小组合作,利用“封条”隐喻构建动态模型:
归纳出表观遗传的核心定义:在核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传变化。
呈现散点图(即用户提供的图M和N)。
图M:横坐标为CHG甲基化水平,纵坐标为冷胁迫下表达变化(log2FC)。
图N:横坐标为CHG甲基化水平,纵坐标为冷胁迫下结实率。
提问:“图中的R值和P值说明了什么?甲基化水平与基因表达量、结实率之间存在怎样的数学关系?”
观察图M和N,识别负相关趋势(R为负值,P极小)。得出结论:甲基化水平越低(封条撕得越彻底),基因表达量越高,结实率越高(耐寒性越强)。
展示图2b(我国水稻种质资源“南高北低”分布)。提问:“为什么南方水稻的甲基化水平普遍较高(封条贴得紧),而北方水稻较低?这体现了什么生物学观点?”
结合地理分布,论证“结构与功能相适应”及“进化适应”观点:北方寒冷,水稻在进化中通过降低甲基化水平(预先撕掉封条)来适应低温环境,保证结实率;南方温暖,维持高甲基化以避免不必要的能量消耗。
“我们观察到了低温下‘去甲基化’和‘耐寒性增强’同时发生,但这能证明‘去甲基化’一定是耐寒的原因吗?如何排除它是由于其他因素导致的伴随现象?”
“请利用‘基因封条’的原理,设计一个实验,在不使用低温处理的情况下,验证‘去甲基化’(撕封条)能直接导致水稻耐寒。”
介绍实验材料:冷敏感型水稻、5-氮杂胞苷(一种DNA甲基化转移酶抑制剂,作用是抑制甲基化,即‘化学撕封条剂’)。
运用假说-演绎法设计实验方案。
检测 ACT1 基因表达量、检测植株的耐寒性(或结实率)。
若实验组在常温下也表达了 ACT1 且表现出耐寒性,则证明DNA去甲基化是耐寒性产生的充分条件。
将“基因封条”隐喻迁移至人类健康领域。“如果抑癌基因被异常高甲基化(被错误地贴死封条),会导致癌症。相比于基因突变(书页被撕毁),表观遗传修饰(书页被粘住)有什么特点?”
认识到表观遗传修饰具有可逆性(封条可以撕下来),这为疾病治疗提供了新的希望(如表观遗传药物)。
“基于此原理,你认为开发去甲基化药物治疗癌症的前景如何?在生活方式上,我们可以做些什么来维持健康的表观遗传状态?”
讨论不良生活习惯(吸烟、酗酒、熬夜)可能导致的异常甲基化。
承诺践行健康的生活方式,并意识到作为公民应关注生物技术在医疗应用中的伦理与安全问题。